Vaisala Oyj:n tilintarkastajia ovat KHT-yhteisö PriceWaterhouseCoopers Oy ja Hannu Pellinen KHT.
Tilintarkastuspalkkioita maksettiin vuonna 2008 yhteensä 178 539 euroa (200 957 euroa vuonna 2007) ja muita palkkioita 109 310 euroa (116 437 euroa vuonna 2007).
Vaisala-konsernin tilintarkastusyhteisö PriceWaterhouseCoopersille maksamat tilintarkastuspalkkiot vuonna 2008 olivat 135 735 euroa (149 939 euroa vuonna 2007) ja muut palkkiot 90 975 euroa (76 800 euroa vuonna 2007). Muille yhteisöille maksetut tilintarkastuspalkkiot vuonna 2008 olivat 42 804 euroa (51 017 euroa vuonna 2007) ja muut palkkiot 18 335 euroa (39 637 euroa vuonna 2007).